Inicialmente composto por palestras de teóricos convidados com temas relacionados à arte e/ou da arte e educação. Em sua organização original havia também mesas de debate com relatos de experiência docente e comunicações orais. Em geral, o evento acontece em dois ou três dias no CAp. João XXIII. As inscrições são gratuitas e podem ser feitas em no site oficial do projeto. Os textos são publicados em anais do evento e distribuídos gratuitamente.
Em parceria com o MIRADA – Grupo de Estudo e Pesquisa em Visualidades, Interculturalidade e Formação Docente da Faculdade de Educação da UFJF, liderado pelos professores Francione Oliveira e Olga Egas (FACED/UFJF), em 2017, o Colóquio Arte em Trânsito modificou sua estrutura para se concentrar em reflexões, ações e compartilhamentos que problematizem o impacto das múltiplas visualidades nos processos educativos e na formação do professor. O objetivo central do colóquio nesse novo formato será o diálogo e a troca de experiências entre diferentes gerações de professores, principalmente os da área de Arte. Para isso propõe a aproximação dos licenciandos de Artes Visuais e Pedagogia da UFJF e de outras instituições do cotidiano e das práticas pedagógicas do Colégio de Aplicação João XXIII, como também das ações de professores da rede municipal de Juiz de Fora e estadual de Minas Gerais.